Интересную проблему тут обнаружили некоторые товарищи (а раньше вот тут). Вроде как при обычной установке VMware ESXi (в том числе, версии 4.1) для физических сетевых адаптеров (pNic) 1Gbit выставляется настройка не Auto Negotiate, а 1000 Mbit Full Duplex.
А вот лучшие практики VMware (например, KB 1004089) говорит нам, что лучшая настройка - это Auto Negotiate как на адаптере, так и на порту физического коммутатора, куда включен хост (можно использовать также и 1000<->1000):
Но вот 1000<->Auto как мы видим не является хорошей практикой, ибо Auto Negotioation включает в себя договаривание устройств не только о скорости и дуплексе, но и такие параметры, как flow control, backpressure, inter-frame packet timing (наверное, там еще страшные слова есть).
Таким образом, нужно либо на свиче также поставить настройку 1000 - Full Duplex, либо поменять на хосте VMware ESX настройки в Auto для сетевых адаптеров: